Las ligas fueron las mismas que en FIFA 97.
El juego contó con 11 ligas de las cuales deja un total de 189 clubes.
Ligas[]
| Escudo | País | Nombre | No. Equipos |
|---|---|---|---|
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Alemania | 1. Bundesliga | 18 |
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Brasil | Serie A | 18 |
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Escocia | Premier League | 10 |
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España | Liga BBVA | 20 |
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Estados Unidos | A-League | 20 |
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Francia | Ligue 1 | 18 |
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Inglaterra | Premier League | 20 |
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Italia | Serie A | 18 |
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Malasia | M-League | 15 |
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Holanda | Eredivisie | 18 |
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Suecia | Allsvenskan | 14 |